プーノはスペイン人がペルーを征服したあとの1668年に建設されました。チチカカ湖の周辺ではプレ・インカ時代から文明が栄えていましたが、原住民たちはチチカカ湖に逃れて、ウロス島のようなトトラで作られた島に移り住みました。