国指定史跡は貝塚、古墳、都城跡、城跡、社寺跡、関跡などの遺跡で、歴史または学術上価値の高い場所です。史跡のうち学術上の価値が特に高く、日本文化の象徴たるものは特別史跡に指定されています。国指定名勝は庭園、橋梁、渓流、海浜、山岳など芸術的または観賞上価値の高い場所です。
対馬市
壱岐市
長崎市
佐世保市鹿町町
大村市
島原市
南島原市
長崎市鳴滝町
佐世保市瀬戸越
松浦市
長崎市出島町
長崎市(魚見岳台場跡、四郎ヶ島台場跡、女神台場跡)
東彼杵郡波佐見町
平戸市
佐世保市吉井町
西海市
雲仙市
五島市
佐世保市
北松浦郡小値賀町
南松浦郡新上五島町